No HC-FMRP-USP estão localizados diversos laboratorios em diferentes locais, incluindo subsolo, primeiro e segundo andares e, em muitos deles, as atividades estão divididas entre rotina e pesquisa. Esses laboratórios estão situados em diversos setores do Hospital, incluindo o Bloco G, o Serviço de Medicina Nuclear, o Setor de Imagem (Radiodiagnóstico, Angiografia e Radiologia Intervencionista, Tomografia Computadorizada, Ultrassonografia, Ressonância Magnética e Radioterapia), o Setor de Cardiologia e, ainda, diversos setores para realização de Provas Funcionais (Pneumologia, Endocrinologia, Gastroenterologia, Nutrologia) e tratamentos específicos (Centro de Infusão de Medicamentos Biológicos e Centro de Reabilitação para doenças musculo-esqueléticas, Centro de Referência para o Tratamento de Hepatites e doenças Hepáticas crônicas).
O Bloco G concentra a maior número de laboratórios, incluindo Hematologia (subsolo), Moléstias Infecciosas (primeiro andar); Nefrologia, Imunologia, Imunologia Molecular, Nutrologia, Dermatologia, Endocrinologia e Gastrenterologia (segundo andar).
Desde sua inauguração em 1956, o HCRP tem contado com laboratórios próprios para atender as necessidades da sua rotina hospitalar, sendo organizados e administrados por docentes da FMRP-USP e, servindo, circunstancialmente, também à pesquisa. Por ocasião da inauguração do novo HCFMRP-USP no campus da USP, em 1978, os laboratórios foram transferidos para o Bloco G, ocupando área total de 6342,1m2. Já na época, os métodos automáticos de alto rendimento, executados por equipamentos compactos, já davam conta de grande parte dos exames da rotina. Assim, diversas metodologias foram desenvolvidas aplicáveis aos interesses específicos dos docentes, inclusive os de pesquisa.
Atualmente, em área de mais de 2000m2, distribuídos nos três andares do Bloco G, estão os laboratórios de pesquisa supervisionados por docentes do Programa, incluindo Endocrinologia (Margaret de Castro e Ayrton Moreira), Rastreamento neonatal (Lea Maciel), Metabologia (Milton Foss, Francisco Jose de Albuquerque e Paula, Cristina Foss-Freitas), Nutrologia (Vivian Suen), Dermatologia (Ana Roselino e Marco Andrey Frade), Imunologia (Paulo Louzada-Júnior), Imunologia Molecular (Eduardo Antônio Donadi), Moléstias Infecciosas e Parasitárias (Roberto Martinez, Valdes Bollela, Alcyone Machado), Gastrenterologia (Ana Martinelli) e Nefrologia (Marcio Dantas, Eduardo Coelho) e o laboratório de Hematologia e Citogenética (Rodrigo Calado, Belinda Simões, Roberto Passetto, Eduardo Rego e Marco Antonio Zago). Os laboratórios apresentam condições de descarte de material de resíduos com atividade infectante plenamente habilitada para funcionamento de acordo com a ANVISA. Dispõem, também, de descarte de material com resíduo radioativo, com plano de radioproteção realizado pelo Serviço de Física Médica e Radioproteção e aprovado pelo CNEN. Conta, ainda, com a infraestrutura de equipamentos de informática e dispõe de rede de informática extensa responsável pelo desenvolvimento de softwares para aplicação médica, além de equipamentos de software desenvolvidos localmente para pós-processamento de imagens médicas. Nesta área, localiza-se a Unidade de Pesquisa Clínica, criada por meio de uma chamada pública FINEP, cujo projeto foi coordenado pelo prof. Eduardo Coelho, docente do programa. Todos esses laboratórios de Pesquisa Clínica do Bloco G participam do Sistema de Gestão de Qualidade implantado pelo Hospital das Clínicas da FMRP-USP desde 2008. Esses laboratórios contam com 15 técnicos para exames de rotina e pesquisa.
A infraestrutura para pesquisa inclui equipamentos e procedimentos para sequenciamento automático, clonagem e subclonagem, análise de expressão gênica por PCR em tempo real, hibridação in situ, ELISA, cromatógrafos líquidos de alta eficiência, contadores gama e beta, equipamentos para análise de proteômica, imunoistoquimica e imunfluorescência, nefelometria, FACS e citogenética por FISH, MLPA e arrays. Em termos de grandes equipamentos, destacam-se os analisadores Bioquímicos, Imunológicos e Hematológicos, Coagulômetros e Analisadores Automáticos de Células. Além de todo suporte de equipamentos estruturais, incluindo: microcentrífugas, centrífugas refrigeradas, freezers -70°e -20°, microscópios Invertidos e de fluorescência com câmera digital para fluorescência e software p/ captura e análise de imagem, agitadores, banho-maria, máquina de gelo, sistema de esterilização de material de laboratório, capelas de exaustão com fluxo, sistema infravermelho de análise de DNA.
O Setor de Medicina Nuclear está instalado em área de 300 m2, no segundo andar do Hospital, contando com 4 Médicos Nucleares, 7 Técnicos em Medicina Nuclear e 8 profissionais de Enfermagem e é coordenado por um docente do programa (Lauro Wichert-Ana), oferecendo facilidades para execução de projetos, relacionados com avaliação nuclear de órgãos e sistemas. Este setor foi beneficiado com apoios financeiros em pesquisa, tendo sido contemplado com a aquisição de 3 equipamentos cintilografia (gama câmaras): Aparelho de SPECT/CT modelo Philips BrightView XCT; Aparelho de SPECT modelo Philips BrightView G-Cam; Aparelho de Cintilografia Miocárdica SIEMENS C-CAM; Workstation EBW Philips de Processamento de Imagens em Medicina Nuclear, e Software ANALYZE SISCOM, Mayo Clinic Foundation.
Setor de Radiologia:
i) a seção de Radiodiagnóstico está instalada em área de 1380m2, onde se localizam salas de preparo e onze salas de exames, equipadas com aparelhos para realização de exames radiológicos convencionais e especializados e aparelhos de mamografia, utilizando-se tecnologias digitais;
ii) a seção de Angiografia e Radiologia Intervencionista tem área de 110m2, onde estão instalados: um aparelho de angiografia digital com detector plano e um aparelho tipo arco de angiografia digital com intensificador de imagem;
iii) a seção de Tomografia Computadorizada tem área de 75m2, onde estão instalados dois aparelhos de tomografia computadorizada, sendo um helicoidal “single slice” e outro “multislice de 16 canais”;
iv) a seção de Ultrassonografia tem área de 125m2, onde estão instalados: 6 aparelhos de grande porte e 3 aparelhos portáteis. O serviço tem capacidade para realização de exames avançados com Doppler colorido e elastografia;
v) a seção de Ressonância Magnética conta com área de 205m2, onde estão instalados dois equipamentos supercondutores de última geração: um aparelho de 3 Tesla, com 32 canais de RF e gradiente dual de alto desempenho com 80mT, e outro de 1.5 Tesla, com 16 canais de RF e gradiente dual de alto desempenho com 80mT. O serviço tem capacidade de realização de exames com técnicas avançadas como ressonância magnética funcional do encéfalo, espectroscopia de hidrogênio e de fósforo, volumetria de estruturas, quantificação de gordura e de ferro hepático e outros; contando ainda com apoio de laboratório de processamento de imagens com softwares específicos;
vi) Seção de Radioterapia: conta com uma área de 960m2, incluindo consultórios, secretaria, recepção e agendamento e salas de planejamento e tratamento, onde estão instalados: dois Aceleradores Lineares, inclusive com capacidade para radioterapia por intensidade modulada (IMRT), radiocirurgia e radioterapia estereotáxica fracionada; um sistema de gerenciamento Lantis-CMS; Braquiterapia de Alta Taxa de Dose (HDR); Equipamentos de dosimetria completo;
vii) Seção de Radiologia de Emergência: com uma área de 375m2, onde estão instalados: Um equipamento de angiografia digital convencional, dois aparelhos de TC, sendo um helicoidal “dual slice” e outro multislice com 64 canais, três aparelhos de ultrassonografia, sendo um portátil. O complexo do Centro de Ciências as Imagens e Física Médica, U.E. e Campus, conta com cerca de 280 funcionários entre técnicos de radiologia, biomédicos, médicos, físicos, pessoal administrativo, incluindo pessoal especializado em arquivamento eletrônico e em informática.